1、改进腹泻便秘
益生菌可以改善肠道菌群平衡，从而改善便秘与腹泻，活性乳酸菌进入人的肠道内，通过生长代谢，促进肠胃内有益菌的稳定抑止肠内腐坏物质形成，进而确保了肠胃机能的稳定。
2、协助养分的消化
许多益生菌在肠胃内能够产生消化酶，这些消化酶可以帮助身体更加好的消化所摄入食品类及消化吸收食物中营养成分，因此许多家长给孩子补充益生菌确实是有帮助的。
3、改善肠道功能
益生菌可以刺激肠道免疫功能，增强抵抗力，而益生元作为益生菌的“食物”，能够促进益生菌粉生长，也间接具有改善肠道和增强免疫力的作用，所以说益生菌粉的作用与功效非常丰富，不过也主要是针对消化系统。
4、减轻乳糖不耐症
益生菌可以溶解乳清蛋白变为乳酸，进而减轻乳糖不耐症问题，有利于营养元素在肠胃里的消化。此外双岐杆菌和乳杆菌不但能形成多种维生素、胆碱、叶酸片等营养元素，而且能通过抑止一些维生素溶解来维护维生素的供给，具有减少血氨、改进肾脏功能的功效。
二、补充益生菌的注意事项
虽说益生菌可以改善腹泻便秘，其实腹泻者，在过多益生菌粉进入体内后，还会导致加重腹泻症状，所以一定要控制摄入量。此外益生菌的温度不能超过40摄氏度，不然就会丧失活力，像一些粉剂、糖衣片、胶襄等，都需要用不高于40摄氏度的水吞服，否则益生菌粉的作用与功效几乎全都失效。